水利部水文水资源监控工程技术研究中心于2006年4月经水利部批准组建，依托单位为南京水利水文自动化研究所。中心实行管理委员会领导下的主任负责制。根据工程中心任务、目标和社会需求，下设科技研发部，质检资料部，培训咨询部和合作推广部。

　　中心实行“开放、流动、竞争、协作”的运行管理机制。充分利用南京水利水文自动化研究所现有的人才、技术和设备优势，通过联合攻关、技术创新和技术辐射等形式，加快水文水资源监控先进设备的研发，促进科技成果的转化与推广应用。

　　主要任务：

　　应用现代科学技术，依靠体制、机制和科技创新，组织研发与完善自动化水平较高的水文水资源监控所需要的设备与控制、通信和网络信息服务系统;开展水文水资源监控的技术研究、开发、交流、培训和咨询等;承担国家及行业有关技术标准及规范的制定或修订的技术工作，全面提高科研技术水平和科技成果转化能力，建立科技服务和推广运行体系。

　　主要研究方向：

　　水文水资源管理信息系统采集与传输技术

　　水文水资源监控与调度技术和先进设备

　　节水与水生态信息化技术

　　水文水资源管理系统工程规划、设计与咨询

　　国家标准、行业标准及规范的编制

　　科研技术和科技成果转化

　　科技服务和推广运行体系